В 1999 году в ООО «АЙТАКС» начала работать испытательная лаборатория, в которой каждая партия принимаемого сырья и отпускаемой продукции проходила жесткую проверку. Высокое качество поставляемых ингредиентов  снискало ООО «АЙТАКС» заслуженное признание клиентов, которыми стали ведущие предприятия пищевой и парфюмерно-косметической промышленности.

Одним из клиентов компании "АЙТАКС" была легендарная Томилинская птицефабрика. Предприятие, успешно проработавшее семь десятков лет,  в конце 90-х оказалось банкротом, на нем было введено внешнее управление. В 2001 году  общим собранием акционеров ЗАО «Томилинская птицефабрика» Алексей Грицина был избран председателем Совета директоров общества. Ему и его коллективу предстояло решить непростую задачу по выводу томилинского гиганта из кризиса. Специалистами «АЙТАКС» была разработана и представлена акционерам ЗАО «Томилинская птицефабрика» стратегия и программа реструктуризации. После утверждения программы реструктуризации собранием акционеров была проделана огромная работа, и в 2004 году ЗАО «Томилинская птицефабрика» завершило период выхода из кризиса. Были сбалансированы обязательства, упорядочены активы, проведена реструктуризация подразделений. Функционировали выделенные бизнес-единицы: «Комплекс переработки яйца», «Легковой автотехцентр», «ТомТелеком», «Комбинат питания». Кроме того,  было принято решение о перепрофилировании территории птицефабрики, поскольку возобновление птицеводства требовало колоссальных затрат и не представлялось перспективным. Поэтому в 2004 году здесь началось создание  «Техно-логистического комплекса «Томилино».  Такое название получил уникальный индустриальный парк, в проектировании которого приняли участие ведущие российские и зарубежные специалисты. В короткие сроки были построены и введены в эксплуатацию: складской терминал для хранения замороженных продуктов питания емкостью 11000 паллето-мест с офисной пристройкой, склад класса «В» площадью 1500 м2, склад класса «А» площадью 6700 м2, склад класса «В+» площадью 8000 м2.

Параллельно  с  работой  над  Томилинским  проектом  менеджмент  Группы  компаний  «АЙТАКС» принимает  решение  о  создании  собственной  компании  для  координации  работ  в  области девелоперской  деятельности  и  реализации  крупных  девелоперских  проектов  на  базе  новейших концепций строительства. В 2004 году создается ООО "АЙТАКС-Инвест".

Презентация Техно-логистического комплекса "Томилино", которая собрала более двухсот гостей -  специалистов в области логистики, консультантов, брокеров, инвестиционных аналитиков и журналистов, состоялась в марте 2005 года в отеле «Рэдиссон Славянская». С сентября 2005 года функции управляющей компании Техно-логистического комплекса «Томилино» были возложены на новое структурное подразделение, получившее название «Техно-логистическая компания «Томилино» (ТЛК «Томилино»). Эта компания стала также и девелопером комплекса, обеспечивая координацию строительства новых складов и работу с потенциальными арендаторами и собственниками.

В 2005 году на территории «Техно-логистического комплекса «Томилино» были введены в эксплуатацию склад класса «А» - К4 – общей площадью 7866 кв. м, который арендовала Группа компаний «Вертикаль» и  первая очередь склада класса «А» К2.1 общей площадью 16848 кв.м. Его арендатором стала международная логистическая компания Tablogix.

Уже к 2006 году Техно-логистический комплекс «Томилино»  вышел на новый уровень развития. Проект был представлен на крупнейших международных выставках коммерческой недвижимости MIPIM-2006 в каннах, MIPIM-Asia-2006 в Гонконге, EXPOREAL-2006 в Мюнхене и  вызвал интерес не только у потенциальных арендаторов качественных складских сооружений, но и у международных инвестиционных фондов.

К 2007 году общая площадь складских помещений на территории Техно-логистического комплекса «Томилино» превысила 228 тыс. кв. м.  Он стал одним из признанных лидеров рынка индустриальной недвижимости в Московской области. Список его арендаторов пополнился известными компаниями, такими как сеть универмагов «Фамилия», «Baon», «Sela», группа компаний «Виктория» и многими другими. Партнерами общества  в проекте создания Техно-логистического комплекса «Томилино» стали два европейских инвестиционных фонда Fleming Family & Partners  и  Immoeast.

В 2007 году управляющая компания «ООО «Технологистическая компания «Томилино», которую возглавил Алексей Березин, стала победителем конкурса «Профессиональное признание-2007» в категории «Лучшая управляющая компания».

В этом же году с  целью  реализации  девелоперских  проектов в рамках Группы компаний "АЙТАКС" было  создано  ООО  «АЙТАКС-Управление проектами».  На  компанию  были  возложены  функции  девелопера  «Техно-логистического  комплекса «Томилино»,  проектов  по  созданию  объектов  офисной  и  торговой  недвижимости  в  Подмосковье, Санкт-Петербурге и Ростове-на-Дону. 

В 2008 году Томилинский проект получил статус Правительства Московской области: Промышленный округ «Логистический парк  «ТЛК  «Томилино».  В  этом  же  году  акционеры  ЗАО  «Томилинская  птицефабрика»  достигли  общего  решения зафиксировать  стадию  стабилизации  совместной  деятельности  и  продолжить  реализацию  собственных  бизнес-проектов независимо друг от друга. 

Второе приоритетное направление деятельности Группы компаний "АЙТАКС"  - агробизнес - начало развиваться в  2004  году, когда были приобретены  птицеводческий  комплекс  «Рыбинский  Бройлер»  в  городе  Рыбинске  Ярославской  области и  сельскохозяйственное предприятие ОАО «Кленовское» (Волгоградская область, Жирновский район).  В  2005  году  были  структурированы  предприятия,  занимавшиеся  агробизнесом и учреждена  Агропромышленная группа "АЙТАКС-Агро".

На поля Агропромышленной группы вышла новая техника: современные комбайны «Лексион-580» и «Мега-360», эффективные посевные комплексы «Борго», «Гаспардо», Тракторы «Атлес-936», «Кировец-744». Благодаря новой технике и передовым технологиям управления было рекультивировано из залежи более 19 тысяч гектаров пахотных земель. По  итогам уборки урожая в 2005 году ОАО «Кленовское» заняло первое место во Фроловском округе Волгоградской области и было награждено Почетной грамотой главы администрации Волгоградской области. Кроме того, почетной грамотой главы области была награждена бригада по заготовке кормов ОАО «Кленовское». Председатель Наблюдательного Совета Агропромышленной группы «АЙТАКС-Агро», Алексей Грицина. был удостоен  Национальной премии имени Петра Столыпина «Аграрная элита России» в номинации «Повышение плодородия и возрождение земель сельхозназначения».

К 2006 году «АЙТАКС-Агро» расширило производственные площади до  25 тысяч гектаров, что явилось определяющим моментом для развития собственного семеноводства. В том же году  для обеспечения проектов в сфере животноводства было образовано ООО «АЙТАКС-Молоко». Началась реконструкция четырех старых ферм и проектирование строительства нового комплекса. Было принято решение полностью обновить стадо, которое планировалось разместить на модернизированной молочной ферме. Решение было реализовано в 2007 году, когда из Голландии были доставлены в хозяйство 400 нетелей голштино-фризской породы.

Кроме того 2007 год для Агропромышленной группы АЙТАКС-Агро» ознаменовался началом развития нового направления животноводства – промышленного разведения овец. В селе Романовка Жирновского района Волгоградской области была введена первая очередь овцеводческой фермы  на 500 племенных маток и 30 баранов-производителей. Высокие показатели выполнения бизнес-плана дали основания для дальнейшего развития этого направления. Совместно с учеными  Всероссийского государственного научно-исследовательского института животноводства был подготовлен план племенной работы на 5 лет, согласно которому овцеводческие хозяйства появились также в селах Ершовка и Кленовка Жирновского района Волгоградской области. В апреле 2011 года ООО "АЙТАКС-Молоко" получило статус племенного репродуктора по волгоградской породе овец.

В 2008  году в  связи  с  диверсификацией  деятельности  Группы  компаний  «АЙТАКС» было  принято  решение  о  создании  ООО  «Управляющая  компания  «АЙТАКС», которая  взяла  на  себя  выполнение  обеспечивающих  функций,  непосредственно  не связанных  с  производством:  управление  финансами,  управление персоналом, юридическое  сопровождение,  административно-управленческие  и другие функции.

В 2009  году для  осуществления  управления  объектами коммерческой  недвижимости,  технической  и  коммерческой  эксплуатации,  комплексного  обслуживания  зданий,  сдачи  в аренду офисов и складов, работы с арендаторами было создано ООО "АЙТАКС-Управление недвижимостью".

В этом же году было торжественно открыто специализированное овцеводческое предприятие "Эко-ферма Селишки"  в деревне Селишки Назаровского сельского округа Рыбинского района Ярославской области.